作者:唐雪勇,刁庆春,李鑫等,重庆市中医院皮肤科 湖南中医药大学第二附属医院皮肤科 湖南中医药大学中医诊断学湖南省重点实验室
1 代谢组学技术概述
代谢组学旨在对人体内所有小分子代谢物进行 定性、定量分析,并明确其与疾病生理病理的关系。 代谢组代表了基因表达、表观遗传、蛋白质活性和环 境影响的最终点,是发生在特定表型上的生化过程的直接、功能性反射[6]。代谢组学主要分析技术平 台包 括 核 磁 共 振 ( nuclear magnetic resonance, NMR) 、液相色谱质谱联用( liquid chromatograph mass spectrometer, LC-MS) 、气相色谱质谱联用( gas chromatography mass spectrometer, GC-MS) 等[7]。代 谢组学研究方法有靶向代谢组学和非靶向代谢组 学,前者以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有 针对性地、特异性的检测与分析,具有灵敏度高、定 量准确的特点,但只能对少数已知代谢物进行检 测[8];后者能全面检测生物整体代谢组,寻找代谢 特征,明确代谢物,进而解释代谢物及其代谢通路与 生命过程或生命状态的关联,但其灵敏度、准确性较 前者差[9]。近年来,整合二者优点针对中低丰度代 谢产物检测的广泛靶向代谢组学应运而生[10]。
2 银屑病诊疗生物标志物的代谢组学研究
运用代谢组学技术,通过检测体内外各种致病 因素刺激下,生物体代谢产物的变化;并运用生物信 息学技术,揭示与疾病发生发展密切相关的特异性 代谢生物标志物;从而根据代谢生物标志物的变化, 实现疾病的早期诊断及复发诊断[11]。利用代谢组 学技术,探寻基于血清、组织、尿液等临床生物样本 的银屑病代谢生物标志物,逐渐成为本病早期诊断、 临床分型等方面的研究热点。
2. 1 血液样本 早期的代谢研究[1213]发现寻常性 银屑病( psoriasis vulgaris, PV) 患者血清中二高-γ-亚 麻酸、血小板激活因子、白三烯 B4 表达增高; 而花 生四烯酸、二十二碳五烯酸水平降低。近年,采用 GC-MS 方法研究[1415]发现, PV 血清中 α-酮戊二酸、 天冬酰胺、天冬氨酸、异亮氨酸、苯
2. 2 尿液样本 尿液作为机体最重要的代谢终端 产物,因其样本采集无创和便捷,适用于大规模筛 查。Setkowicz 等[20]采用 HPLC-MS/MS 方法分析发 现, PV 患者尿液代谢产物中 Tetranor12 ( S) -HETE 含量增高, 12 ( S) -HETE 减低,提示上述代谢物可 能参与疾病的发生发展。Alonso 等[21]采用 1HNMR 技术研究发现PV 尿液中柠檬酸盐、丙氨酸、琥 珀酸甲酯、
2. 3
3 银屑病关键代谢通路与代谢网络研究
基于系统生物学观点,疾病的发生发展是在致 病因素作用下,引起机体关键基因、蛋白及代谢物分 子含量、结构、功能及相互关系的改变,进而出现内 源性小分子代谢物群异常表达,导致生物代谢网络 失衡而呈现的具有相对稳定性、特征性的病理表 型[27]。利用 KEGG 对差异代谢物进行注释并分类, 即可得到相关的代谢通路。基于 MetPA 2. 0 可以对 代谢通路进行富集分析,筛选出最重要的代谢通路 进行研究,基于潜在靶标代谢路径,构建各代谢途径 间的联系与转化,为全面认识发病机制提供了可视 化表征[28]。Kamleh 等[29]采用非靶向 LC-MS 方法 确定了银屑病的三个重要的代谢途径: ①精氨酸和 脯氨酸; ③甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸; ③丙氨酸、天冬 氨酸和谷氨酸。Gu 等[30]基于 HMDB 等数据库,进 一步分析发现其潜在代谢标志物主要涉及甘油磷脂代谢、鞘脂代谢、花生四烯酸代谢、胆汁酸生物合成 等代谢通络,提示银屑病发病可能与其代谢途径紊 乱有关,同时通过收集3 个系统的靶蛋白,筛选出了 PI3K-Akt、 Ras、 Rap1、 EGFR、黏着斑、 Kaposi's
4 基于代谢组学的银屑病药效与预后评价研究
药物代谢组学旨在通过分析比较药物干预前后 生物体代谢谱的改变,评价药物的效应机制,预测药 物的毒性与不良反应,为临床个体化用药提供科学 依据[31]。基于代谢组学技术和生物信息学方法,筛 选银屑病疗效评估与预后的代谢标志物,并构建可 视化的代谢网络,有助于阐明药效作用机制,进而实 现精准治疗[3233] 。
4. 1 银屑病临床药效代谢组学研究 Kamleh 等[29]研究发现,
4. 2 银屑病动物和细胞模型的药效机制研究 Hollywood 等[36]利用
4. 3 银屑病预后风险的代谢组学研究 Lawler 等[38]发现采用代谢组学技术可用于鉴定银屑病患 者糖基化产物,如 1-酸性糖蛋白、结合珠蛋白、 1-抗
5 结语与展望
代谢组学以其全局性的视角,在筛选银屑病差 异代谢物、阐释发病机制、构建综合效应代谢网络及 评价药物效应机制等方面均取得了可喜研究成果。 然而代谢组学仍存在研究局限性,如代谢产物存在 个体差异;代谢产物易受到饮食、环境、年龄等诸多 因素干扰;不同团队研究结果可重复性不高,缺乏多 中心、大样本的临床验证。代谢通路和网络分析虽 提供了重要的生物学信息,但相关证据的临床实用 性仍需进一步确证[40]。随着代谢组学和生物信息 学技术的迅猛发展,高通量、高灵敏性代谢分析检测 平台的开发;精准诊疗新代谢标志物和药物新靶标 的发现;标志物检测试剂盒的研发;个性化医疗干预 与饮食调理等有望成为今后银屑病代谢组学研究的 持续热点,代谢组学以其系统性的研究思维必将获 得更好研究实践,助推生物医药科学的发展和进步。
参考文献略。
来源:唐雪勇,刁庆春,李鑫.银屑病代谢组学研究进展[J].中国皮肤性病学杂志,2020,34(04):458-461.
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