前言
食管
多基因风险评分(PRS)可整合多个风险位点效应来量化个体遗传易感性,但既往全基因组关联研究(GWAS)多以欧洲人群为主,所得出的PRS在非欧洲人群中预测能力下降。目前,即便是基于中国人群的UGI肿瘤PRS,也仅在生物样本库中得到验证,能否在已开展筛查的高发区人群中切实改善风险预测,证据仍有限。
近期,《Science Bulletin》发表了一项研究,在中国真实世界的高发区内镜筛查人群中验证了PRS的实用价值。其基于中国UGI肿瘤高发区内镜筛查队列,量化了遗传、生活方式及二者联合对UGI肿瘤风险的影响,评估了PRS在风险分层中的临床价值,并发现了一个GC潜在新位点,为基于风险分层的个体化预防提供了证据。
GWAS新发现:6p12.1为GC潜在新易感位点
该研究纳入2015—2022年来自中国三个UGI肿瘤高发区(林州、磁县、肥城)内镜筛查项目的5556名参与者,队列中位年龄62岁,男性占57.16%。共识别2013例UGI肿瘤,含1050例ESCC和1015例GC;其中203例ESCC和170例GC为中位随访5.2年期间新发病例。
GWAS重复验证了已知的10q23.3 UGI肿瘤共享易感位点,并在GC中发现了一个潜在的新易感位点6p12.1,该位点在meta-GWAS中仍具有全基因组显著性,位于PRIM2基因附近的基因间区——PRIM2可能通过促进DNA复制与错配修复参与肿瘤发生。
基因层面分析显示,PLCE1和NOC3L与ESCC及GC均显著相关;表达分析提示NOC3L在肿瘤组织中上调,而PLCE1表达下调;cis-eQTL分析提示先导SNV可能直接调控NOC3L表达。这些结果为UGI肿瘤的基因特异性致病机制提供了新的生物学线索。
遗传因素显著增加UGI肿瘤风险,
PRS对贲门胃癌的预测效果更佳
研究表明,高遗传风险人群UGI肿瘤风险显著升高,最高PRS组GC风险为最低组的2.35倍。在前瞻分析中,PRS每增加1个标准差,ESCC风险升高(HR 1.20,95% CI 1.05–1.37),GC风险升高(HR 1.44,95% CI 1.24–1.67)。若将人群按基因风险高低分为四等份,与得分最低的1/4人群相比,得分最高的1/4人群罹患ESCC的风险增加了1.70倍,GC风险增加了2.35倍。
GC亚型分析显示,PRS与贲门胃癌(CGC)的关联强于非贲门胃癌(NCGC),即PRS对贲门胃癌的预测效果更佳。这可能与PRS构建训练集的人群结构有关——所用PRS来源队列中有较高比例的CGC来自与本研究相似的高发区,因而更能捕捉CGC的遗传易感性,提示未来需进一步开发亚型特异性PRS。此外,风险提前期(RAP)分析提示,低遗传风险者达到与高遗传风险者相同风险水平的年龄,ESCC晚约11.7年、GC晚约13.1年,提示PRS可为个体化筛查起始年龄提供参考。
健康生活方式获益显著
遗传与不利生活方式叠加,风险进一步升高
研究表明,不利生活方式者发病风险显著升高(ESCC HR 1.78;GC HR 1.81)。遗传与生活方式可共同放大风险:与低遗传风险且生活方式有利者相比,高遗传风险合并不利生活方式者ESCC风险增加2.75倍、GC增加4.18倍,但未观察到显著的相加或相乘交互作用。
值得关注的是,坚持健康生活方式可在各遗传风险层级降低风险,且在高遗传风险人群中获益最为显著:高遗传风险人群中坚持有利生活方式者,ESCC的绝对风险降低(ARR)达9.16%、GC达8.38%;高遗传风险者的累积发病率在有利生活方式下大幅下降(ESCC由14.24%降至5.08%,GC由13.23%降至4.85%),几乎可抵消高遗传易感性带来的累积风险。膳食获益在ESCC中还呈现跨遗传风险层级的显著梯度。
PRS为传统模型带来额外预测价值
研究表明,在传统模型基础上加入PRS,可显著提升风险判别与重分类能力。在含年龄、性别和健康生活方式评分(HLS)的基础模型上加入PRS,可显著改善判别效能(ESCC的C指数提升6.5%,GC提升7.2%),并带来风险重分类改善,综合判别改善(IDI)值也支持这一改善。各项敏感性分析(排除缺失协变量者、排除随访首年确诊者、Fine-Gray竞争风险模型、性别与年龄分层)结论保持一致,其中PRS与风险的关联在男性中略强、在≤60岁人群中更为明显。
结论
该研究在中国UGI肿瘤高发区内镜筛查人群中验证了两个基于普通人群开发的PRS能在高发区筛查人群中有效进行风险分层,并发现了GC潜在新易感位点6p12.1。遗传风险与不利生活方式独立增加UGI肿瘤风险,而坚持健康生活方式可在各遗传风险层级降低风险,在高遗传风险人群中几乎可抵消高遗传易感性带来的累积风险。研究提示,PRS有望辅助确定个体化筛查起始年龄、优化内镜资源配置,但作者也指出,基因分型成本及PRS带来的预测增益仍是实际应用的制约,需与其他风险因素结合并优化筛查资源。总体而言,本研究支持将遗传信息纳入UGI肿瘤的分层预防策略,并为制订与个体遗传背景相匹配的生活方式建议提供了循证依据。
参考文献
Feifan He, Xianhui Ran, Hao Jiang, et al. Genome wide association analysis and association of genetic risk and lifestyle with upper gastrointestinal cancer among an endoscopy-screened cohort in China. Science Bulletin, 2026, 71: 2316-2325.
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审批编号:CN-187595
有效期至:2027-07-07
撰写:Chen
审核:Amaia
排版:Liberos
执行:Aurora