近些年，越来越多的研究发现利用特定益生菌、肠菌移植（fecal microbiota transplantation，FMT）等肠道微生态干预方法可以取得一定的效果，但该疗法目前仍然存在诸多争议和不足，也缺乏权威性肯定意见和认同。
在
14条共识意见如下（点击文末“医脉通指南”小程序卡片可查看共识全文）：
▶ 共识意见1
儿童ASD的患病率逐年上升，与遗传和环境因素均存在关系（证据等级：4，推荐强度：弱）
▶ 共识意见2
儿童ASD与
▶ 共识意见3
肠道菌群失调通过微生物-肠-脑轴（gut brain-axis，GBA）发挥致病作用（证据等级： 4，推荐强度：弱）
▶ 共识意见4
特定微生态制剂能够对儿童ASD发挥治疗作用（证据等级：3，推荐强度：弱）
▶ 共识意见5
FMT在儿童ASD的治疗中是一种科学有效的治疗方式 （证据等级：2，推荐强度：强）
为证实ASD患儿的肠道菌群失调和神经系统功能之间的关系，将ASD儿童肠微生物移植到无菌小鼠中，发现其可以诱导标志性异常行为；而将健康人群的肠道微生物群移植到ASD小鼠可以改善相关异常行为，因此肠菌失调可能发挥了驱动作用，临床上通过FMT对患儿进行治疗具有科学依据。
以往前瞻性研究评估了FMT对ASD患儿行为和胃肠道症状的改善作用，结果显示治理后胃肠道症状严重程度降低80%，行为症状严重程度降低23%；社交技能等行为症状也显著缓解，且肠菌的多样性得到提高；血浆的相关代谢特征包括
FMT在ASD儿童治疗中的长期效果受到多方面影响，如受体年龄、性别、供体类型及治疗方案等，从本质上看归结于供体菌群对ASD儿童肠道核心菌群的塑造程度及其持续定植能力，这一过程存在个体差异。
▶ 共识意见6
良好的肠菌供体是FMT治疗安全性和有效性的重要保证（证据等级：2，推荐强度：强）
▶ 共识意见7
FMT治疗儿童ASD中的不良反应以及处理方式需要识别和重视（证据等级： 3，推荐强度：弱）
目前FMT被较多应用于治疗儿童
目前的研究报道中发现有一过性的腹胀、腹泻症状，可能和肠菌定植过程中类“药物赫氏反应”有关，但未见严重不良事件。不良反应处理方式如下：（1）轻度：肠道不耐受症状如偶有恶心、呕吐、腹胀及腹泻等，多为自限性，可暂不予以处理。（2）中度：上述症状无好转，可对症处理：腹泻患儿可口服蒙脱石散，发热患儿可进行物理降温、补液和口服非甾体类退热药，恶心呕吐给予
▶ 共识意见8
FMT治疗儿童ASD的纳入排除标准与治疗流程（证据等级：3，推荐强度：弱）
为保证FMT治疗儿童ASD的效果，应建立严格的筛选要求：患儿伴有腹泻、便秘、腹胀等胃肠道症状或存在
目前推荐FMT一个治疗周期为6个月，口服胶囊治疗为4个疗程（每个疗程为口服肠菌胶囊12d，停用18d），4个疗程结束后观察2个月为一个治疗周期。在治疗第2个疗程结束后需进行1次评估：若有效则继续当前治疗，若无效则立即行肠菌检测并更换供体后重新给予2个疗程FMT治疗。更换供体后若有效，则继续予以2个疗程巩固治疗；若仍无效则视为FMT治疗无反应，此时不应继续给予FMT治疗。对于移植治疗2个疗程有效的ASD人群，则应继续予以2个疗程巩固治疗后进行随访。随访期为半年，半年后再进行量表评分和肠菌检测，评估肠菌定植效果和临床改善情况：孤独症儿童行为量表（autism behavior checklist，ABC）评分或儿童孤独症评定量表（childhood autism rating scale，CARS）评分较基础评分下降＜10%、或肠菌检测发现供体菌群多样性＜20%则视为菌群定植退化，继续予以2个疗程巩固治疗；否则继续予以随访。FMT无效的患儿可以联合小肠液移植即全菌谱移植进行尝试治疗，由于目前没有大规模的临床试验，此处不做进一步推荐。
目前FMT终止使用的情形：（1）患儿肠道不能耐受胶囊或菌液并产生严重不良反应；（2）FMT干预2个疗程无反应；（3）患感染性疾病，一段时间内需持续使用抗生素；（4）使用激素、免疫抑制剂等药物；（5）随访期间菌群定植未发现退化。经TET导管输注菌液者需要做肠道准备，口服胶囊者不需要万古霉素口服清洁肠道。其中口服胶囊的方法：≤6岁患儿，每日口服2次，每次2粒胶囊（每粒儿童胶囊不低于0.10g±0.05g）；＞6岁患儿，每日口服2次，每次3粒。也可采用供体粪便和受体体重按比例方法进行菌液或胶囊配置：1g供体粪便/1kg受体体重。
综上，FMT的治疗时间较长，需要进行多次治疗以促进肠菌稳定定植，具体剂量与疗程建议结合患儿的情况而定，但需要治疗与评估交替进行。目前还没有强有力的证据证明最佳的移植疗程，需要更多的临床证据支持。
▶ 共识意见9
FMT治疗儿童ASD的评价指标（证据等级：2，推荐强度：弱）
临床疗效指标以ABC评分、CARS评分作为主要量表评估；社交反应量表（social responsiveness scale，SRS）、临床总体印象量表−总体改善（clinical global Impression scale-improvement，CGI-I）评分作为次要评估量表；Gesell发育量表、儿童心理发育评估量表、韦氏智力发育量表等作为补充评估量表。条件允许时以血5-HT、炎症因子指标[（白细胞介素（interleukin，IL）−2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-1β、IL-17A、IL-10、干扰素（interferon，IFN）−γ）]、肠道菌群检测作为客观指标参考。
疗效评价参考《肠道菌群移植临床应用管理中国专家共识（2022版）》：其中菌群多样性恢复至供体菌群多样性50%以上为治疗显效；治疗第12周ABC评分＜67分且CGI-I评分1～2分或5个ABC子量表中至少2个较基线有70%或更大的下降，而其他子量表均未出现10%或更大的上升为治疗有效；在此基础上CARS量表评分下降超过15%也作为治疗有效的参考。血清5-HT水平下降，IL-17A等炎症因子水平下降提示治疗有效，可以继续行肠菌移植。
脑部脑功能磁共振成像的相关脑功能区和脑脊液中的自体免疫相关指标与ASD具有相关性，在未来的研究中具有成为潜在评价指标的可能。
▶ 共识意见10
全菌谱移植可以作为儿童ASD肠菌移植探索治疗的新方法（证据等级： 3， 推荐强度：弱）
▶ 共识意见11
胶囊口服是FMT治疗儿童ASD的推荐治疗方式 （证据等级：2，推荐强度：强）
▶ 共识意见12
肠道菌群、肠屏障功能以及免疫功能是FMT前必要的评估项目（证据等级： 3，推荐强度：强）
▶ 共识意见13
寻找ASD的标志物或建立风险评估是十分必要的（证据等级：3，推荐强度：强）
▶ 共识意见14
开发基于肠道菌群的人工智能模型以加强ASD的早期筛查和肠道菌群定植效果评估（证据等级：5，推荐强度：弱）
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文献索引：中华预防医学会微生态学专业委员会, 中华医学会肠外肠内营养分会微生态与营养协作组, 中国人体健康科技促进会肠道微生态与肠菌移植专业委员会, 等. 肠菌移植治疗儿童孤独症谱系障碍中国专家共识（2025版）[J]. 中国微生态学杂志, 2025, 37(11): 1241-1249, 1259. doi: 10.13381/j.cnki.cjm.202511001
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