JCC:溃疡性结肠炎患者停用抗肿瘤坏死因子治疗与持续治疗后的黏膜纵向转录组分析
发布时间:2026-09-17   |   来源:IBD Daily
关键词: 溃疡性结肠炎

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来源:IBD Daily

溃疡性结肠炎患者停用抗肿瘤坏死因子治疗与持续治疗后的黏膜纵向转录组分析

Longitudinal transcriptomic analysis of mucosa in ulcerative colitis after anti-tumor necrosis factor withdrawal compared to continued treatment

Journal of Crohn's and Colitis

PMID: 42586604  [IF=10.3]


B2


背景


抗肿瘤坏死因子 (TNF) 治疗是中重度溃疡性结肠炎 (UC) 的重要治疗手段,可有效诱导并维持缓解。然而,长期使用可能增加感染、肿瘤、过敏反应及治疗失应答的风险,同时带来持续的经济负担。对于已达到临床、生化及内镜缓解的患者,能否安全停药仍缺乏可靠依据。既往研究显示,部分患者停用抗TNF后可长期维持缓解,但另有相当比例发生复发,目前尚缺乏能够提前识别复发高风险患者的有效生物标志物。



方法


该研究基于挪威开展的BIOSTOP多中心、前瞻性、随机对照、非盲临床试验,共纳入163例UC患者,其中82例停用抗TNF治疗,81例继续维持治疗。所有患者入组前均接受抗TNF治疗≥1年,并处于深度缓解状态,包括临床缓解≥3个月、连续2次粪便钙卫蛋白<200 mes="">1,组织学炎症活动采用Robarts组织学指数 (RHI) 评估。


研究选取直肠黏膜样本进行bulk mRNA测序,经质量控制后共154例患者纳入转录组分析。通过差异基因表达分析,比较停药组复发与持续缓解患者的基线表达差异,并分别开展基线与复发/病情复燃或随访结束时的纵向配对分析;进一步利用KEGG、GO和Reactome进 行通路富集分析。此外,研究以IBD患者肠黏膜单细胞RNA测序图谱作为参考,采用DWLS算法进行细胞类型去卷积,比较不同临床结局及不同时间点的黏膜细胞组成变化,并结合RHI评估转录特征、细胞组成与组织学炎症之间的关联。



结果


在2年随访期间,停药组有44例患者 (54%) 发生临床复发,停药至复发的中位时间为8.6个月。维持治疗组有10例患者 (12%) 发生病情复燃,自入组至病情复燃的中位时间为13.3个月。


研究首先比较了停药后复发与持续缓解患者的基线直肠黏膜转录组。主成分分析显示两组高度重叠,差异表达分析亦未发现显著差异基因,TNF及其受体TNFRSF1A、TNFRSF1B的表达也无明显差异。进一步进行细胞去卷积后,两组基线时各类免疫细胞、基质细胞及上皮细胞的比例同样无显著差异。上述结果表明,停药前黏膜基因表达特征及细胞组成尚不足以区分停用抗TNF治疗后复发与维持缓解的患者。


在停药后出现复发的患者中,共发现1,546个基因表达上调、878个基因表达下调。其中,上调基因主要为CXCL9、CXCL10、FPR2、OSMR、PDPN、REG1A/REG3A等炎症及组织重塑相关基因。细胞去卷积显示,复发时单核细胞/巨噬细胞、单核吞噬细胞及THY1⁺FAP⁺PDPN⁺活化成纤维细胞明显增加。通路分析进一步显示NF-κB、Toll样受体、补体及中性粒细胞脱颗粒等固有免疫通路显著富集,同时伴随细胞外基质重塑。此外,CD4+ T细胞、CD8+ T细胞及B细胞等适应性免疫细胞也有所增加,并出现IL-17相关通路富集,提示复发过程中固有免疫与适应性免疫共同参与 (图1)。


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图1 停用抗TNF治疗后发生复发的UC患者肠粘膜表现出强烈的固有免疫反应


在持续治疗但出现病情复燃的患者中,与基线相比共发现1,653个基因表达上调、1,064个基因表达下调。除了一些与停药后复发观察到的重叠的基因外,这部分患者表现出更明显的T细胞介导型反应的转录特征,包括IFNG、STAT1、GZMB等基因上调,CD8+ T细胞比例增加,并伴随干扰素、T细胞受体和PD-1等相关信号通路富集。因此,虽然停药后复发和持续治疗期间复燃均表现为活动性UC炎症,但后者的T细胞相关转录特征更加突出 (图2)。


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图2 持续接受抗TNF治疗期间发生病情复燃的UC患者肠粘膜表现出更强的T细胞介导型转录特征


研究进一步发现,两组患者均存在多条与现有或潜在治疗靶点相关的炎症通路激活,包括IL-12/23、整合素α4β7及JAK-STAT通路,同时TL1A相关基因TNFSF15以及B细胞相关靶点CD19、TNFSF13B表达也有所升高。



结论


本研究未发现能够预测UC患者停用抗TNF后复发的基线黏膜转录组或细胞组成特征。停药后复发及持续治疗期间病情复燃均表现出明显的活动性UC炎症特征,包括髓系细胞、T细胞及活化成纤维细胞增加,并伴随多条炎症和组织重塑通路激活;其中持续治疗期间病情复燃呈现更突出的T细胞相关特征。此外,多种现有或潜在治疗靶点在复发和病情复燃时上调,提示这些患者可能存在进一步个体化治疗的机会。总体而言,该研究虽未找到可靠的停药前预测标志物,但为理解抗TNF停药后复发及治疗期间病情复燃的炎症机制提供了重要依据。


致谢

中南大学湘雅三医院 吴承皓

中南大学湘雅三医院 郭洋 景方敏

中南大学湘雅三医院 陈杰

中南大学湘雅三医院 王晓艳

对本篇文章解读做出的贡献


参考文献

1. Rapp E, Berset IP, Umu SU, et al. Longitudinal transcriptomic analysis of mucosa in ulcerative colitis after anti-tumor necrosis factor withdrawal compared to continued treatment. J Crohns Colitis. 2026;20(8):jjag121. doi:10.1093/ecco-jcc/jjag121


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