作者:齐星伦,杨大干,浙江大学医学院附属第一医院检验科
临床实验室拥有多维度、多模态的检验大数据,对疾病诊断、治疗监测和预后判断至关重要。然而,传统的数据分析方法,难以挖掘蕴藏在数据中潜在的诊断与预测信息,限制了检验医学价值的深度开发。新一代信息技术的发展,为检验领域提供了新方法和新模式。如大型语言模型(largelan⁃guagemodels,LLM)可为检验结果提供符合临床思维路径的通用性的结果解释,机器学习(machinelearning,ML)可从大规模数据中学习复杂模式、识别隐藏关联并构建预测模型实现结果精准解释[1]。LLM和ML相互补充,可构建基础框架支撑和精准模型适配的结果解读体系。当前,ML在疾病早期筛查、辅助诊断、风险分层和预后评估中显示巨大的潜力,但仍面临数据质量参差不齐、模型泛化能力不足、可解释性差等挑战[1⁃2]。疾病预测模型可估计特定疾病诊断的存在概率,也可预测特定疾病在未来的发生概率,包括疾病诊断、疾病分期、预后评估和未来风险预测[3⁃4]。本文系统评估ML在检验领域的疾病预测模型的构建框架、算法平台及应用现况,分析ML的局限性和优化策略,对规范并加速ML的临床转化、释放其潜力具有重要意义。
1 机器学习疾病预测模型的构建框架
ML疾病预测模型的开发与验证是一个系统性的、多阶段迭代的过程。为了确保研究的透明度、可重复性和临床转化潜力,可参照个体预后或诊断的多变量预测模型透明报告(transparentreportingofamultivariablepredictionmodelforindividualprog⁃ nosisordiagnosis,TRIPOD)-人工智能(artificalin⁃telligence,AI)报告规范与PROBAST⁃AI质量评估框架、国际临床化学和检验医学联合会(IFCC)工作组推荐等共识[3⁃5],构建符合国际共识要求的过程框架体系。
1.1 问题定义 ML疾病预测模型适用于疾病诊断、风险分层、风险预测及实验室结果解释等方面,不适用于小样本、高噪声数据,以及临床决策高度依赖动态、非结构化信息、需要深度因果推断的场景[5]。研究实施前应获得机构伦理审查委员会的批准,明确数据使用范畴和患者知情同意方式。回顾性研究可豁免患者知情同意,但需确保数据匿名化。前瞻性研究或临床应用阶段,则需签署知情同意书并允许患者撤回。应建立数据治理与隐私保护机制,对源数据进行脱敏和去标识化并限制不必要数据披露,并确保模型推理过程的隐私安全[6⁃7]。
1.2 数据收集 数据质量是构建可靠ML疾病预测模型的基石。遵循可查找、可访问、可互操作、可重用的原则进行数据收集与预处理[8]。需制定数据管理计划,涵盖数据全生命周期,明确定义变量、数据结构、统一格式和标准化处理流程,确保数据的代表性、准确性、完整性、规模性、合规性和可及性等质量要求[5,9]。预测变量的选择需考虑成本效益、时间相关性和与结局变量的独立性。常见预测变量的类型可包括人口学特征、生活方式、环境因素、实验室指标、影像学表现和病史信息等。结局变量的选择需保证其明确性、可靠性、时间相关性、独立性和数据稀疏性。常见的结局变量,二分类变量如复发或未复发、阳性或阴性等;时间事件变量如术后生存时间、复发时间等;连续变量如检验结果值;多分类变量如疾病分期、功能状态评分等。
1.3 数据探索 数据探索是对数据集进行检查、处理和
1.4 特征选择 将原始数据转化为能更好地表示潜在问题的特征表示,包括特征增强、构建、筛选和转换,能够提升模型预测能力、扩展可用性并增强解释性[11]。特征筛选策略可分为:(1)经验共识驱动,如文献回顾、专家建议;(2)数据驱动,如统计学或ML算法筛选。递归特征消除是ML特征筛选的主流方法,通过迭代移除对结局变量贡献最小的特征,获得最优特征子集,提升模型性能和泛化能力,并简化模型易于解释[12⁃13]。
1.5 数据分组 为客观评估模型性能并防止过拟合,将数据划分为训练集、验证集和测试集,需预防数据集之间的泄露[5]。训练集用于学习数据模式,验证集用于模型选择和超参数调优,测试集用于最终评估模型的泛化能力,常见的划分比例为7∶1∶2或8∶1∶1,具体依据数据量和任务调整。对于样本之间差异不大的数据可采用简单随机抽样。对于类别不平衡的数据,采用分层抽样确保各类别比例一致。对于时间序列数据,应按照时间顺序划分,保证训练数据早于验证或测试数据。处理多模态数据时,需确保不同模态数据在时间或空间上的同步性,并对各模态分别预处理后进行特征融合。
1.6 算法实现 依据问题类型(分类/回归)、数据特性(线性/非线性、维度、样本量)和性能要求选择合适的ML算法[5]。常见选择逻辑回归、决策树、支持向量机、随机森林、梯度提升、K近邻、朴素贝叶斯及神经网络等ML算法,也可采用强化学习、深度学习、Transformer等新一代ML算法。通常采取同时构建多种模型进行比较的策略。使用分层K折交叉验证(常用5或10折)框架在训练集内部进行模型选择与超参数优化(如网格搜索、随机搜索、贝叶斯优化)。每个子集轮流作为验证集,其余K⁃1个子集用于模型训练,最终选择在交叉验证中平均性能最优的模型和超参数组合。
1.7 模型评估 验证模型在未见过的测试集上的表现,评估其泛化能力,识别过拟合或欠拟合[5]。按照临床场景和因变量的不同,模型的评价指标也不一样。对于连续性变量,可以采用均方误差、均方根误差、平均绝对误差、决定系数来评价。分类变量的模型评价可采用C指数、受试者工作特征(ROC)曲线及ROC曲线下面积。基于混淆矩阵指标在各类别样本平衡时采用准确率最有效,但对于类别不平衡的数据集,准确率会产生误导,可使用精密度(阳性预测值)、精确度(召回率)、F1分数来进行评价。
1.8 模型解释 为克服ML疾病预测模型的“黑箱”问题,应理解模型决策机制,增强模型的可靠性、可信度和临床接受度[14⁃15]。模型的可解释性方法:(1)局部解释,用于解释单个样本的预测结果,如LIME(localinterpretablemodel⁃agnosticexplana⁃tions)、SHAP(shapleyadditiveexplanations)值[16⁃18];(2)全局解释,分析模型整体行为,如混淆矩阵、ROC曲线及ROC曲线下面积、均方误差等;(3)可视化工具,如特征贡献热力图、决策边界图等;选择合适的解释工具需依据模型类型和解释需求。1.9 模型验证 模型验证可分为[3⁃5]:(1)内部验证:使用交叉验证或bootstrap重采样技术在开发数据集上评估模型的稳定性和偏差;(2)外部验证:在完全独立的数据集(不同时间、地点、人群或设备)上评估模型的泛化能力和鲁棒性,是模型临床转化的金标准,但实施困难;(3)多中心验证:通过来自多个中心的数据进行训练和/或验证,提高模型的泛化能力,可采用联邦学习等技术保护不同中心的数据隐私。
2 机器学习疾病预测模型算法平台及应用
ML疾病预测模型在检验医学中的应用,通过有效的数据共享机制、适宜的算法实现以及强大的开发平台,可以提升疾病的预测和诊断能力。
2.1 数据共享 数据共享是驱动ML疾病预测模型性能提升,尤其是泛化能力的关键。通过汇聚来自不同医疗机构的海量、多中心检验数据,构建具代表性和多样性的数据集。数据共享应遵循相关法律法规,采用加密、匿名化/去标识化等技术手段,确保数据的合法合规使用。为克服隐私保护与数据孤岛、标准化与标注质量等障碍,可采用创新的数据共享模式,包括:(1)联邦学习,各机构本地训练模型,仅交互梯度参数,如PySyft框架[19];(2)隐私保护技术:利用区块链的去中心化、不可篡改技术,记录数据使用权限和访问日志,实现数据的安全追溯与访问控制[20];(3)数据合成技术,利用生成对抗网络合成虚拟患者数据,缓解数据不足问题[21]。
2.2 算法实现 ML算法是构建疾病预测模型的核心环节。算法的选择需依据问题类型(分类、回归、聚类等)、数据特性(数据类型、维度、线性/非线性关系、样本量)和性能要求(准确性、可解释性、效率)进行[5]。ML算法可分为:(1)分类任务,如疾病诊断、风险分层,常用算法有逻辑回归、支持向量机、决策树、随机森林、梯度提升机、K近邻和朴素贝叶斯;(2)回归任务,如生物标志物水平预测、风险评分,常用算法有线性回归、支持向量机、随机森林等;(3)图像数据,如血细胞形态学、
2.3 算法平台 Python作为编程语言,提供丰富的库和框架。如scikit⁃learn提供经典ML算法,包括数据预处理、特征选择、模型训练和评估功能,适用于各种监督学习和无监督学习任务;TensorFlow和PyTorch是深度学习的两大主流框架,支持复杂的神经网络模型构建、训练和部署,适用于图像识别、自然语言处理等任务。R语言也能实现相关算法。此外,一些ML集成平台,如KNIME、Weka,适合不具备编程背景的人员进行数据探索、模型构建和评估[22⁃23]。GoogleCloudAutoMLTables可自动化ML流程中的特征工程、模型选择、超参数调优等[24]。腾讯觅影OpenML、华为云ModelArts,提供医学预训练模型(如血细胞形态学检测),数据增强工具(如生成罕见样本),支持迁移学习微调,解决类别不平衡问题[25]。
2.4 基于检验数据的ML疾病预测模型 利用常规、易于获取的检验数据构建ML疾病预测模型,是当前检验医学数智化转型的重要方向。目前,基于常规检验数据的ML疾病预测模型研究已在多个领域取得进展。肿瘤学是其应用最为广泛的领域之一,特别是在肝癌、
了肾脏疾病(如
3 机器学习疾病预测模型的局限性
尽管ML在检验医学领域展现出显著应用价值,但其技术落地仍面临多维度的挑战。
3.1 数据质量与合规性瓶颈 检验数据存在显著的异构性问题,包括缺失值、异常值污染、检测方法学差异导致的系统性偏差,以及跨机构数据标准不统一引发的格式壁垒[3⁃4]。高质量训练数据的获取受限于隐私保护要求与数据孤岛现象,多中心协作难度大,难以形成具有广泛人群代表性的数据集。尤为关键的是,若训练数据缺乏对不同种族、社会经济背景群体的覆盖,可能引入系统性偏倚,导致模型在特定人群中的预测效能显著下降,引发伦理风险[36]。
3.2 模型性能与可靠性缺陷 模型泛化效能受限于训练数据的分布特征,在跨地域、跨设备的临床环境中易出现预测精度衰减[3⁃4]。过拟合风险导致模型过度捕捉训练数据噪声,外部验证尤其是多中心验证的缺失,使得真实世界性能评估存在盲区。此外,复杂算法的“黑箱”特性造成决策逻辑不可解释,临床难以验证预测依据,增加了监管审核与错误溯源的难度。动态临床场景中,数据漂移与概念漂移现象会导致静态模型性能随时间退化,持续监测与更新机制的缺失成为技术落地的障碍[36]。3.3 技术整合与应用挑战 现有信息系统技术架构兼容性不足,模型部署面临接口标准化、算力资源适配等技术壁垒。监管层面,ML疾病预测模型从开发验证到临床应用的全周期管理框架尚未完善,质量控制与效果评估缺乏统一规范。从实施成本看,高性能模型的构建依赖持续的算法优化、算力投入及专业人才支撑,基层机构推广难度较大。值得关注的是,过度依赖自动化工具可能削弱检验人员的临床判断能力,而模型误判或系统故障可能引发诊疗风险,需建立人机协同的安全冗余机制[5]。
4 机器学习疾病预测模型的优化策略
针对检验医学领域ML疾病预测模型应用的挑战,需从数据治理、模型优化及技术落地3个维度构建系统性解决方案,推动技术效能与临床价值深度融合。
4.1 数据质量提升与合规性强化 建立标准化数据采集规范,通过自动化清洗工具处理缺失值、异常值及方法学偏差,构建完整性、一致性、时效性等多维度质量评估指标。采用统一的数据格式、编码体系和传输协议,破除跨机构数据格式壁垒,实现信息系统间的无缝对接。采用分层抽样、过采样等技术平衡训练数据的人群代表性,确保种族、性别、社会经济地位等维度的均衡覆盖。引入公平性评估指标,如人口学均等性、机会均等性,运用对抗去偏算法修正系统性偏差[37]。应用联邦学习、差分隐私、同态加密等隐私增强技术,在保障数据安全前提下构建多中心共享数据集,解决数据孤岛与隐私合规冲突[19]。
4.2 模型性能优化与可靠性提升 优先选用决策树、线性模型、规则列表等内在可解释算法,复杂模型通过LIME解析个体预测逻辑,利用SHAP量化特征贡献度,结合特征重要性热力图实现全局决策透明化[18]。建立预测精度和解释能力的双维度评估标准,避免过度追求性能而牺牲临床信任度。将多中心外部验证纳入模型开发必需环节,采用地理分层、设备差异、时间跨度等真实场景参数构建独立测试队列,评估跨人群、跨机构的预测稳定性。引入数据漂移监测技术,通过在线学习算法动态更新模型参数,应对临床环境变化导致的概念漂移问题,建立“训练-验证-迭代”的闭环优化机制。4.3 技术整合落地与应用生态构建 开发API接口与中间件,解决信息系统的应用问题,实现ML疾病预测结果与检验报告的整合。采用容器化部署(如Docker)与微服务架构提升模型迁移灵活性,构建弹性算力资源池以适配数据规模增长,确保系统在高并发场景下的稳定性。研发低算力依赖的高效算法,如特征筛选优化、模型蒸馏技术。开发图形化操作平台降低技术使用门槛,普及应用。建立包含临床结局(如诊断准确率、预后预测效能)、卫生经济学(如医疗成本、资源利用率)、用户体验(如报告解读效率)的多维评估体系,通过真实世界研究验证模型临床价值[3⁃5,36]。基于长期随访数据构建反馈闭环,利用迁移学习技术持续优化特定人群或场景的预测性能。
5 总结与展望
基于ML和常规检验数据的疾病预测模型,可提升疾病早期诊断、风险分层及预后评估的精准度与效率,增强检验报告的临床决策价值。展望未来,ML及LLM,如DeepSeek、ChatGPT(chatgenera⁃tivepre⁃trainedtransformer)等,将与新兴检验技术,如多组学分析、高通量测序、可穿戴设备数据,多种技术协同研发出更精准、更个性化的诊断与预测工具[38⁃39]。LLM凭借其跨模态语义理解能力,可在多维度、多模型的检验报告解读中发挥基础支撑作用,推动从单一指标预测向全病程多维度建模的范式转变[40]。ML聚焦“黑箱”模型的透明化解析,通过结合SHAP值归因分析、决策树规则提取及LLM的自然语言解释生成技术,提升临床对ML算法决策的信任度与接受度。严格的多中心外部验证、动态性能监测机制及基于差分隐私的合规数据共享框架,将成为技术落地的核心保障。特别是LLM在医学文本生成中的应用,需建立专门的伦理审查标准,确保结果解释的科学性与公平性[40]。通过加强ML素养教育、参与跨学科合作,检验人员将在ML模型的开发、验证、部署和管理中发挥核心作用,确保技术进步真正服务于临床需求,最终提升医疗服务的公平性与精准性[41]。随着LLM与ML的深度融合,检验医学正迎来数据智能驱动的变革期,有望充分释放数据要素的医疗价值,助力精准医疗迈入更高效、更智能的发展阶段。
参考文献略。
来源:齐星伦,杨大干.基于机器学习和检验数据的疾病预测模型的构建及应用挑战[J].临床检验杂志,2025,43(11):805-809.
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