肾移植患者发生排斥反应的dd-cfDNA阈值为>1%，dd-cfDNA水平与肾活检结果相关性较好，其水平升高与各类肾移植排斥反应（包括亚临床排斥反应）的发生和严重程度相关；且当dd-cfDNA>0.5%时，检测临床和亚临床排斥反应的效果或优于生化标志物。此外，将dd-cfDNA与传统肾移植标志物相结合，可提高排斥反应诊断区分能力。

但由于其他移植后或生物学并发症（如肥胖、自身免疫性疾病复发和感染）可能影响dd-cfDNA水平，导致阴性预测值降低，因此在解读结果时应予以考虑，部分dd-cfDNA检测阳性结果可能为“假阳性”。

dd-cfDNA与天冬氨酸转氨酶（AST）/丙氨酸转氨酶（ALT）比值相关，且在预测急性排斥反应方面，基于单核苷酸多态性（SNP）和二代测序（NGS）的dd-cfDNA检测优于传统肝功能检查。既往研究显示，基于SNP的dd-cfDNA诊断急性排斥反应的曲线下面积（AUC）为0.975，敏感度达100%，特异度达90.9%，阴性预测值为100%，提示dd-cfDNA低于阈值时，可避免侵入性活检。此外，cfDNA半衰期较短（数分钟-1.5小时），可实时反映移植物损伤情况；而生化肝功能检查半衰期较长，限制了对肝移植物持续变化的监测能力，这进一步表明dd-cfDNA检测在肝移植中的优势。

值得一提的是，疑似慢性排斥反应（伴有炎症和C4d沉积的纤维化）、活动性病毒和细菌感染以及血管和胆道并发症也可能导致dd-cfDNA水平升高，需引起临床关注。

在检测排斥反应方面，dd-cfDNA敏感度和特异度与EMB相当；同时，dd-cfDNA水平与急性排斥反应严重程度相关，且具有较高阴性预测值：排斥反应发生时其水平升高，抗排斥治疗成功后则下降。

然而，心肌缺血、心肌损伤、妊娠以及多器官移植等因素可能导致患者dd-cfDNA水平升高，但未出现排斥反应，需谨慎对待。另外，dd-cfDNA无法鉴别细胞介导排斥反应和抗体介导排斥反应，未来仍需开展更多研究并获得更多验证结果。

与肾移植、肝移植、心脏移植相似，评估肺移植物损伤的dd-cfDNA阈值为0.5%~1%。目前，关于dd-cfDNA水平如何影响CLAD进展的相关研究较少，且尚无法区分闭塞性细支气管炎综合征（BOS）和限制性移植物综合征（RAS）两种CLAD表型。但现有研究显示，CLAD患者的dd-cfDNA水平升高，且与第1秒用力呼气容积（FEV1）下降相关。另外，需要注意的是，样本采集时间、感染等因素均可影响dd-cfDNA水平，且患者个体变异性较大，若要将dd-cfDNA完全确立为CLAD的诊断生物标志物，还需开展更多研究。