青岛大学附属医院首次报道一例T细胞急性淋巴细胞白血病患者携带TBC1D15-RAB21变异
发布时间:2026-10-12   

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融合基因是急性白血病中常见的分子异常,是白血病发生的关键驱动事件。TBC1D15::RAB21融合最早于2019年在无RAR重排的急性早幼粒细胞白血病(APL)样白血病中被描述,且此后所有报道的病例均涉及髓系恶性肿瘤。


青岛大学附属医院学者近日于《Balkan Medical Journal》首次报道了该融合在T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)中的检出,也是该融合首次在淋系肿瘤中被报道。文章通讯作者为苏湛教授和赵春亭教授。

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患者基本情况


青少年女性,表现为颈部淋巴结肿大


全血细胞计数正常


右颈部淋巴结活检:T淋巴母细胞淋巴瘤,免疫组化CD3、TdT、CD34、CD99、CD2、CD7阳性,Ki-67增殖指数约90%


骨髓涂片:25%原始细胞


流式细胞术:10.89%异常未成熟T细胞,表达CD7++、CD34+、CD38+、CD99++、CD5+、CD2+、胞质CD3+,部分TdT阳性


形态学原始细胞计数(25%)与流式计数(10.89%)的差异可能归因于穿刺标本稀释


核型分析:正常染色体补体


PET/CT:膈上及膈下高代谢淋巴结肿大,伴骨髓浸润


根据WHO分类诊断为T-ALL


基因检测结果


转录组测序(RNA-seq)鉴定出TBC1D15::RAB21融合,由TBC1D15第5外显子(NM_001146213.3)与RAB21第5外显子(NM_014999.4)移码融合所致


融合事件由17条split reads和9条spanning reads支持


并发突变:


  • RUNX1 p.R1666(c.496C>G,VAF 32.80%)


  • JAK3 p.V678M(c.2032G>A,VAF 16.92%)


  • JAK3 p.M5111(c.1533G>A,VAF 19.41%)


根据AMP/ASCO/CAP体细胞变异解读共识,这些突变被归类为II级变异,具有潜在临床意义


参考基因组:hg19/GRCh37.p13


因通过RNA测序检测且无匹配正常样本,无法确认其体细胞来源


治疗过程


诱导化疗:VDLP方案(长春新碱、柔红霉素、培门冬酶、泼尼松)


  • 第15天:骨髓原始细胞约17.5%


  • 第33天:骨髓涂片31.5%原始细胞,流式检测胸骨34.72%原始细胞,诱导治疗反应差


再诱导治疗:2周期环磷酰胺+阿糖胞苷+6-巯基嘌呤+维奈克拉方案(低剂量维奈克拉)


再诱导后PET/CT示完全代谢缓解,骨髓流式确认MRD阴性


巩固治疗:2个HR系列巩固周期(HR-1、HR-2、HR-3方案)+ 1周期VDLP巩固


异基因造血干细胞移植:诊断后1年进行,移植前骨髓流式示完全MRD缓解


结局:移植期间去世


TBC1D15与RAB21基因背景


TBC1D15:位于染色体12q21.1,含27个外显子,属于脑GTP酶激活蛋白超家族,通过促进RAB7 GTP水解来解开线粒体-溶酶体膜接触


RAB21:同样位于染色体12q21.1,含7个外显子,属于Rab家族单体GTP酶,与整合素相互作用,调节其转运,参与内吞、自噬和逆转录体功能

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图1. 本例的骨髓形态学和TBC1D15::RAB21融合基因。(a)骨髓涂片(Wright染色,×1000)。原始细胞中等大小,核圆形,染色质浓缩,胞质稀少。(b)Integrative Genomics Viewer截图,显示转录组测序得到的TBC1D15::RAB21连接序列。一个移码融合将TBC1D15第5外显子(NM_001146213.3,breakpoint 12:72278801)与RAB21第5外显子(NM_014999.4,breakpoint 12:72175811)连接。连接处两侧的外显子保留了完整序列。RNA-seq在DNBSEQ-T7平台上进行,采用rRNA去除的RNA文库制备方法,PE150读长;该样本共产生25.8 G数据。Clean reads使用STAR(版本2.7.10a)比对到人类参考基因组hg19。使用Arriba(版本v2.3.0)调用融合基因,当confidence = high且totalCount ≥ 3时报告融合。该融合事件由17条split reads和9条spanning reads支持。(c)跨越融合连接处的RT-PCR产物的Sanger测序色谱图。所用引物为:正向5′-GGGCTGGTCCTATTTGGTATT-3′,反向5′-GACTCTGCTTCTTGAATGGAAAC-3′,预测扩增子大小为175 bp。在本文报道的TBC1D15::RAB21变异中,TBC1D15保留了第5外显子的完整序列,而Yao等人¹⁰报道的变异缺失TBC1D15第5外显子3′端4个碱基(GTGA);这4个碱基由蓝线标示。(d)TBC1D15::RAB21融合基因示意图。红色箭头指示breakpoint。本文报道的变异保留了TBC1D15第5外显子的完整序列,这导致下游RAB21阅读框发生移码。

既往TBC1D15::RAB21融合病例回顾


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关键差异:


  • Yao等报道的为框内融合(TBC1D15第5外显子breakpoint 12:72278797与RAB21第5外显子breakpoint 12:72175811)


  • 本文报道的为移码融合(TBC1D15 breakpoint 12:72278801),与Yao等的breakpoint不同,提示为新型融合变异


  • 本文变异保留TBC1D15第5外显子完整序列,导致下游RAB21阅读框移码;而Yao等报道的变异缺失TBC1D15第5外显子3'端4个碱基(GTGA)


讨论与总结


所有已报道的TBC1D15::RAB21融合病例均发生于儿童患者


既往报道仅限于髓系肿瘤,常表现为APL样形态并伴有其他共存突变


无RARA重排的APL样白血病中融合基因并非反复出现,但其基因表达谱独特,提示可能代表候选的新白血病亚型


本病例提示TBC1D15::RAB21可能跨越髓系-淋系界限


据PubMed和Google Scholar检索,这是首次在淋系肿瘤中报道该融合


总结:本文首次在淋系肿瘤中鉴定出TBC1D15::RAB21融合基因,扩展了该融合相关的疾病谱。由于为单例报告, 相关结果应谨慎解读,不能进行统计推断。需要进一步研究阐明该融合的致病机制、临床意义和流行病学特征。



参考文献

Balkan Med J . 2026 Oct 9. doi: 10.4274/balkanmedj.galenos.2026.2026-8-23.










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