作者:
脑肿瘤的精准分割是医学影像分析领域的重要任务,其直接关系到临床诊断、手术规划及预后评估的准确性。
近年来,Transformer 模型凭借其全局自注意力机制,在自然语言处理与计算机视觉领域展现出突破性性能。与卷积神经网络(convolutional neural network, CNN)的局部归纳偏置不同,Transformer 能够通过自注意力动态捕捉图像中的全局上下文信息,这一特性为解决医学图像中多尺度、多模态特征融合问题提供了新思路。2020 年,VisionTransformer(VIT)首次将纯Transformer 架构引入图像分类任务,随后研究者开始探索其在医学图像分割中的潜力。例如,Swin-UNet通过引入层次化Transformer 模块和滑动窗口机制,显著提升了脑肿瘤MRI 图像分割中病灶区域的边缘细节还原能力;TransBTS 等模型则结合CNN 的局部特征提取能力与Transformer 的全局建模优势,在BraTS 等公开数据集上取得了优于传统U-Net 的性能。
尽管如此,基于Transformer 的脑肿瘤MRI 图像分割仍面临诸多挑战:首先,医学影像数据量有限,而Transformer 对大规模训练数据的依赖性可能加剧小样本场景下的过拟合风险;其次,多模态MRI 数据的异质性特征融合机制仍需优化;此外,模型的计算复杂度与临床实时性需求之间的矛盾尚未完全解决。鉴于Transformer 在解决脑肿瘤MRI 分割面临的标注稀缺、多尺度肿瘤精准分割及模型计算效率等关键挑战上的潜力,亟需对其在该领域的应用进展、方法创新及瓶颈问题进行系统综述。
虽然已有综述探讨Transformer 在医学图像分割中的应用,但它们在时效性和任务聚焦深度上存在局限:一方面,未能充分纳入2023 年以来在高效架构和数据利用策略上的最新突破;另一方面,缺乏对脑肿瘤MRI 分割这一特定任务中核心挑战的深入剖析及其针对性解决方案的系统评述,对计算效率、鲁棒性和临床转化可行性的讨论也显不足。因此,本文对Transformer 在脑肿瘤MRI 分割中的最新进展进行系统综述,深度聚焦脑肿瘤MRI 分割任务,追踪评述针对其核心挑战的最新高效模型与数据利用方法;并着重分析当前存在的计算效率、数据依赖、临床部署等技术瓶颈及未来方向,以期为构建鲁棒、高效且可解释的脑肿瘤MRI 图像分割模型提供理论参考。
1. Transformer 的概述及发展
Transformer 是一种强大的深度学习模型,以其注意力机制有效捕捉序列元素间的远程依赖关系。Transformer 最初用于自然语言处理(natural language processing, NLP),后被引入视觉领域:ViT将图像划分为块序列进行处理,突破了CNN的局部感受野限制。为提升效率并适应密集预测任务,Swin Transformer 引入了层次化架构和移位窗口机制,在窗口内计算高效自注意力并通过位移实现跨窗口交互。
在医学图像分析,特别是脑肿瘤MRI 图像分割领域,Transformer 展现出巨大潜力。针对三维医学图像的特点,nnFormer 设计了嵌套式自注意力,结合局部块注意力与全局下采样注意力,同步捕获细节与上下文,并通过跨阶段特征聚合优化多尺度融合。为适配分割任务,Swin-Unet 构建了纯Transformer 的对称编解码器,编码器提取语义特征,解码器结合跳跃连接恢复空间细节,提升边界保持与小目标识别能力。Transformer 架构通过其强大的全局建模能力、灵活的多尺度特征融合机制以及对三维体积数据的适应性,为解决脑肿瘤MRI 图像分割的异质性纹理、不规则形态、微小病灶、边界模糊等关键问题提供了强大的基础框架。
尤其在脑肿瘤MRI 图像分割任务中,这类模型展现出独特优势:nnFormer 通过嵌套式三维注意力精准捕捉脑肿瘤的异质性纹理与不规则形态,解决传统方法对微小病灶漏分割、肿瘤边界模糊的难题;Swin-Unet 则凭借全局上下文建模能力,在复杂脑部MRI 图像中实现肿瘤核心、
2. 模型融合在脑肿瘤MRI 图像分割中的应用进展
近年来,基于Transformer 与CNN结合的混合模型在脑肿瘤MRI 图像分割领域取得了显著进展。这些方法通过融合Transformer 的全局上下文建模能力与CNN的局部特征提取优势,有效解决了传统方法在复杂肿瘤边界、多模态数据融合及长距离依赖建模上的不足。
2.1 混合架构的演进
研究初期,WANG 等提出的TransBTS 和HATAMIZADEH 等提出的Swin UNETR 等模型,通过分阶段融合3D CNN与Transformer 或采用分层注意力机制,初步实现了全局与局部特征的协同建模。然而,这类模型普遍面临计算复杂度高和参数量大的问题。为提升脑肿瘤MRI图像分割效率,后续工作进行了针对性优化:LI 等提出的DenseTrans 和戴昂等提出的改进版TransBTS,通过引入深度可分离卷积和大核分解策略,显著降低了脑肿瘤MRI图像分割计算成本;而LI 等提出的TransBTSV2 则利用可变形卷积动态适应肿瘤形态,在模型轻量化和分割精度之间取得了更好的平衡。
2.2 多模态融合策略
面对脑肿瘤MRI 图像分割中多模态数据带来的核心挑战,研究者们提出了多种创新解决方案以提升模型适应性。针对模态缺失问题,KANG等提出的MCTSeg 模型采用了特征蒸馏技术,通过知识迁移机制有效传递完整模态的信息,缓解了脑肿瘤MRI 图像分割中部分模态缺失带来的性能下降。为了增强不同模态间的有效交互,LEI 等则创新性地引入了临床知识引导的分组策略,其网络模型通过分组机制强化了具有临床相关性的模态特征融合。
在应对脑肿瘤MRI 图像数据稀缺挑战方面,LYU等提出的MWG-UNet++ 模型另辟蹊径,利用Wasserstein 生成对抗网络生成高质量合成数据,有效扩充了训练样本集,逐步提升了模型对复杂多变数据的泛化能力。在脑肿瘤MRI 图像分割模型架构细节优化层面,研究者们着重提升关键区域的分割精度并减少信息损失。例如,RASOOL 等提出的TransResUNet 模型,巧妙地将Transformer 的多头自注意力机制与残差结构相结合,显著强化了对脑肿瘤MRI 图像分割中肿瘤核心等关键区域的分割能力。与此同时,罗康等提出的LFC-UNETR 模型,则设计了密集连接的多头注意力并行结构,有效捕捉长程依赖关系并减少了特征传递过程中的信息丢失,进一步提升了分割的精细度。
2.3 对抗学习与残差结构优化
在对抗学习驱动的医学图像分割领域,研究者们提出了多种创新模型以提升脑肿瘤MRI 图像分割精度与鲁棒性。其中,华楷文等提出的融合双重对抗学习的CNN-Transformer 模型,通过引入判别器进行特征对齐并结合虚拟对抗训练,有效增强了模型对脑肿瘤MRI 图像输入扰动的鲁棒性。与此同时,MWG-UNet++模型则侧重于利用生成对抗网络的对抗机制,优化了脑肿瘤MRI 图像边界的生成质量。而在脑肿瘤MRI 图像分割网络结构设计层面,针对深层网络训练中普遍存在的信息衰减问题,研究者们采用了残差结构改进策略。
例如,
然而,其仍面临计算复杂度较高的问题,特别是Transformer 的自注意力机制部分,同时存在泛化能力不足的挑战,表现为对多中心脑肿瘤MRI 图像数据适应性有限,以及可解释性欠缺的问题,黑箱决策影响了临床信任。未来脑肿瘤MRI 图像分割研究需聚焦于动态稀疏注意力机制以减少冗余计算、进行跨模态扩展融合CT 或PET 等其他影像、采用自动化架构搜索优化混合比例、并增强可解释性例如通过类激活图可视化等方法,同时结合半监督学习与域适应技术,以推动模型在临床实时应用与精准诊疗中的落地。
3. 注意力机制在脑肿瘤MRI 图像分割中的创新
注意力机制通过动态分配权重聚焦关键信息,显著提升了脑肿瘤MRI 图像分割模型对长距离依赖的捕捉能力和特征关联性理解。这一特性使Transformer 突破了传统卷积神经网络在脑肿瘤MRI图像分割中的局部感受野限制,其自注意力机制能够建模像素间的全局长程依赖关系,并通过位置编码与多头注意力机制的协同设计,在保持图像空间结构敏感性的同时,自适应聚焦不同尺度的关键区域。这种全局感知与动态聚焦的优势,为脑肿瘤MRI 图像分割尤其是脑肿瘤边界模糊、跨区域关联复杂的分割任务提供了新的技术路径。
3.1 全局-局部注意力机制平衡
基于Transformer 的脑肿瘤MRI 图像分割方法,其核心改进主要围绕注意力机制的创新与网络架构的融合展开。NGUYEN-TAT 等提出的3D UNet 模型通过结合上下文变换器和双重注意力机制,双向捕捉局部与全局依赖关系以增强特征交互。然而,该方法对小肿瘤边界的精细分割仍存在挑战。ZHANG 等开发的AugTransU-Net 模型在编码-解码器结构中嵌入了增强型变换器与配对注意力模块,显著强化了脑肿瘤MRI 图像长程特征关联能力。但其较高的模型复杂度限制了其在脑肿瘤MRI 图像分割实时应用的潜力。
在平衡全局与局部信息方面,SHEDBALKAR 等提出的TEA-UNet 模型采用了Swin Transformer 与混合注意力机制,有效提升了脑肿瘤MRI 图像多尺度特征融合的性能。尽管如此,其计算效率仍有待优化。而LI 等设计的FocalCross Transformer 模型则通过交叉窗口与焦点自注意力机制,专注于脑肿瘤MRI 图像局部精细交互以降低计算成本。不过,该模型在复杂场景下的泛化适应能力仍需进一步验证。
3.2 注意力机制与多模态融合
在应对脑肿瘤MRI 图像分割中注意力机制与多模态融合的挑战方面,研究者们也提出了基于Transformer 的创新方案。SHI 等开发的M2FTrans模型创新性地引入了模态掩蔽融合变换器机制。该机制的核心优势在于能够动态调整缺失模态的权重,从而显著提升脑肿瘤MRI 图像分割模型在模态缺失情况下的鲁棒性。然而,这种复杂的融合机制也导致了模型结构的复杂化,可能对其在脑肿瘤MRI 图像分割实际临床环境中的部署效率产生不利影响。
另一方面,ZAKARIAH 等提出的DualVision Transformer-DSUNET 模型则采用了双重注意力机制结合多模态特征融合的策略。这种方法旨在更有效地整合来自不同模态的互补信息,以提升分割性能。虽然其跨模态融合能力表现出色,但该模型在跨不同脑肿瘤MRI 图像数据集时的泛化能力仍需更深入探索和验证,以确保其广泛的适用性。
3.3 轻量化注意力机制
在脑肿瘤MRI图像分割领域,尤其是在资源受限的实际应用场景中,模型的轻量化与效率优化已成为关键研究方向。研究者们正积极尝试通过结构创新来平衡模型性能与实用性。其中,ANAYA-ISAZA等提出的CrossTransUnet 模型采用了可分离卷积与交叉注意力机制,这种设计思路有效降低了模型的复杂度,大幅减少了参数量,显著提升了计算效率。然而,其结构设计可能在处理脑肿瘤MRI 图像中极端小目标的分割任务时性能受限,这或许是由于简化结构对细微特征的捕捉能力相对不足所致。
相比之下,刘
当前基于Transformer 的脑肿瘤MRI 图像分割研究在注意力机制优化如全局-局部平衡焦点自注意力、多模态鲁棒性提升如模态掩蔽融合及轻量化设计如可分离卷积方面取得了显著进展,有效增强了特征交互、处理了缺失模态并降低了计算成本。然而,这些方法仍面临核心挑战:精度与效率难以兼得轻量化模型牺牲小目标精度高精度模型结构冗余、泛化能力不足复杂模型跨数据集表现不稳定以及结构复杂性带来的部署障碍计算开销大训练困难。未来研究需着力于开发动态高效的注意力架构以平衡精度与速度、设计泛化性更强的多模态融合方案、并探索端到端优化策略如架构搜索与模型蒸馏,从而推动高性能、高效率、高鲁棒性模型在临床实践中的广泛应用。
4. 多模态处理与缺失模态应对策略
在脑肿瘤MRI 图像分割任务中,多模态处理通过融合不同成像模态提供的互补解剖与病理信息,显著提升了对肿瘤核心、水肿及增强区域的分割精度,尤其能有效区分脑肿瘤中异质性高或边界模糊的病灶。然而,实际临床应用中常面临模态缺失问题。为此,研究者提出了基于生成对抗网络的模态补全、跨模态注意力机制或自适应特征融合等策略,使脑肿瘤MRI 图像分割模型在部分模态缺失时仍能保持鲁棒性,避免因数据不完整导致的性能骤降。
脑肿瘤MRI 图像分割中多模态融合与模态缺失处理技术的结合,不仅增强了模型对复杂临床场景的适应性,降低了对数据采集完整性的严格要求,也推动了自动化分割系统在真实医疗环境中的实用性与可靠性。近年来,Transformer 架构在脑肿瘤MRI 图像分割领域的发展也紧密围绕多模态展开,聚焦于解决模态缺失、计算效率和特征融合等核心挑战。KANG等率先提出结合CNN与Transformer 的混合架构模型MCTSeg,通过多模态特征蒸馏和跨模态融合模块协同利用局部与全局信息,显著提升了脑肿瘤MRI图像分割模型在模态缺失情况下的鲁棒性,但其较高的计算复杂度限制了实际应用。
为优化脑肿瘤MRI 图像分割计算效率,ZHANG等提出的IMS2Trans模型采用共享权重的Swin Transformer 编码器,并结合特征蒸馏正则化和轻量化设计,成功将参数量降至4.47 M,大幅提升了计算效率,然而其在极端模态缺失场景下的适应性仍有待提升。为进一步增强对模态缺失的鲁棒性,SHI 等提出的MMFT模型引入了可学习的融合令牌和掩码自注意力机制,通过空间权重注意力和通道融合Transformer 减少冗余信息干扰,在多个脑肿瘤MRI 图像数据集上取得了最优分割效果,但其模型效率问题依然存在。
在脑肿瘤MRI 图像特征融合策略创新方面,LIN等提出的CKD-TransBTS 模型创新性地融入了临床知识,将多模态MRI 分组处理,并设计双分支混合编码器与特征校准模块,有效降低了脑肿瘤图像分割结果的假阳性率,但其采用的复杂跨模态注意力机制在一定程度上削弱了模型的可解释性。另一项代表性工作是王彩莲等提出的GCTF 模型,该模型通过动态图卷积-Transformer 融合模块和三维适配器捕获局部与全局依赖关系,并结合掩码机制处理缺失模态,在分割鲁棒性方面表现突出,但复杂的多模块结构也增加了脑肿瘤MRI 图像分割模型的训练难度。
针对脑肿瘤MRI 图像分割纯Transformer 架构的优化,YANG等提出的F2Net 模型通过灵活的多模态协同模块和跨模态特征增强模块,有效平衡了共享信息与模态特异性信息,在BraTS 数据集上实现了高精度分割,但其性能对数据质量的高度依赖可能限制其在更广泛场景下的泛化能力。
综上所述,当前脑肿瘤MRI 图像分割研究通过混合架构设计、轻量化策略、临床知识驱动以及动态融合机制等多种途径,在多模态脑肿瘤图像分割的关键问题上取得了显著进展。然而,模型复杂度高、可解释性不足、小样本适应性弱以及在极端模态缺失场景下的性能稳定性等问题,仍是未来研究需要重点优化的方向。现有方法的优缺点相互补充,共同推动着该领域朝着高效、鲁棒且临床实用的目标不断迈进。
5. 计算效率与轻量化设计进展
计算效率与轻量化设计在脑肿瘤MRI 图像分割任务中具有显著优势,主要体现在两个方面:首先,优化后的模型结构和降低的参数量使轻量化算法能在保证脑肿瘤MRI 图像分割精度的前提下,大幅减少计算资源消耗与推理时间,从而适配移动设备或边缘端等资源受限的临床环境。其次,其高效的计算能力支持医学影像的实时或近实时处理,有助于缩短诊断周期;同时,模型较小的存储与内存需求提升了部署灵活性,不仅降低了硬件能耗成本,也为该技术在基层医疗的广泛应用铺平了道路。
针对Transformer 模型在脑肿瘤MRI 图像分割中的应用,提升其计算效率与实现轻量化已成为脑肿瘤图像分割领域的研究热点,相关创新主要从多个角度展开。以Swin Transformer 的窗口化自注意力机制为代表:SHEDBALKAR等提出的模型利用窗口化和移位窗口化机制,有效降低了全局计算复杂度,但模型本身的复杂度和数据依赖性问题仍有待解决;PEIRIS 等进一步将该机制扩展至3D体积数据,提出VT-W-MSA和VT-SW-MSA模块,并结合3D片区合并策略增强多尺度特征建模能力,然而其较高的硬件资源需求仍是瓶颈。这些工作为脑肿瘤MRI 图像分割全局注意力计算提供了优化范例,但后续研究仍需着力于降低资源消耗和缓解数据依赖性。
为了在脑肿瘤MRI 图像分割效率与精度之间取得更优平衡,研究者们积极探索了混合架构与轻量化设计路线。例如,LI 等提出的TransBTSV2 模型融合了3D CNN与宽度扩展的Transformer 块,并引入可变形瓶颈模块以适应脑肿瘤形状变化,无须预训练即可实现高效分割,但其 3D 处理仍依赖较强的算力支撑;ANAYA-ISAZA 等提出的CrossTransUnet 则创新性地结合跨注意力机制与分离卷积,将参数量缩减至标准UNet 的五分之一,并在BraTS 数据集上取得了94%的DSC 值,不过部分模型因复杂度过高存在性能波动。这些混合架构在脑肿瘤MRI 图像局部-全局特征融合方面取得了进展,但模块的复杂性仍有待进一步简化。
面向资源高度受限的脑肿瘤MRI 图像分割部署场景,轻量化策略与数据效率优化成为关键研究方向。ZHANG等提出的IMS2Trans 模型采用共享权重编码器与特征蒸馏策略,在脑肿瘤MRI 图像模态缺失条件下仍能保持高分割精度,但对极端模态缺失的适应性尚存局限。此类工作充分展示了参数压缩的潜力,然而模型的解释性与临床适用性仍是未来研究中亟需突破的瓶颈。
综上所述,从窗口化自注意力机制、CNN-Transformer 混合架构到专门的轻量化设计,当前脑肿瘤MRI 图像分割的研究致力于在计算效率与分割性能之间寻求最佳平衡,为脑肿瘤MRI 图像分割技术的临床落地提供了多样化的解决方案。未来研究的核心挑战将聚焦于如何进一步降低模型对计算资源的依赖,并增强其可解释性以提升临床信任度。
6. 模型结构与模块创新
Transformer 模型在脑肿瘤MRI 分割中展现出显著优势,其核心的自注意力机制能够捕捉长距离依赖关系,有效建模脑肿瘤MRI 图像中肿瘤区域的全局上下文信息,克服了传统卷积神经网络局部感受野的局限性。通过多头注意力模块,模型可并行学习多尺度特征,精准识别肿瘤边界模糊、形态不规则及多区域分布的复杂特征。
6.1 基础模块优化
脑肿瘤MRI 图像分割领域的研究围绕Transformer 架构展开了多样化的创新探索。初期研究主要聚焦于基础模块的改进。例如,PACAL 等提出的模型创新性地采用混合窗口划分策略以动态分配不同方向的注意力权重,并结合残差MLP 缓解梯度消失问题。这些优化有效增强了模型对多尺度特征的捕捉能力,并提升了训练效率。然而,此类早期方法普遍面临脑肿瘤MRI 图像分割数据不平衡和临床验证不足的挑战。
6.2 边缘特征增强与多尺度上下文整合
随着研究的深入,多模态融合与边缘特征增强成为脑肿瘤MRI 图像分割新的研究热点。为提升边界分割精度,ZHU 等提出的模型对Swin Transformer的移位窗口机制进行了改进,以增强脑肿瘤MRI图像局部特征提取能力。该模型进一步引入边缘空间注意块,专门从FLAIR 或T1ce 等多模态图像中捕获肿瘤边界信息,并通过图卷积网络实现多模态特征的有效融合。在此基础之上,VATANPOUR等提出了双尺度Swin Transformer 编码器与双级解码器的设计架构,该架构通过整合脑肿瘤MRI 图像全局上下文信息与局部细节特征,显著提升了模型在肿瘤核心区域的分割性能。不过,这类高度复杂的架构也不可避免地带来了脑肿瘤MRI 图像分割计算资源需求高、推理速度慢等问题。
6.3 自动化架构搜索与动态注意力机制
为平衡脑肿瘤MRI 图像分割模型精度与计算效率,局部-全局协同建模与自动化架构优化成为近期的重要方向。MA 等提出的模型设计了局部与全局双Transformer 编码器,通过分层建模策略分别捕捉脑肿瘤细节特征与长程依赖关系,并辅以3D通道与空间注意力监督模块来抑制背景噪声,在脑肿瘤MRI 图像多模态数据处理中展现出优势。陶永鹏等提出的模型则探索了基于神经架构搜索的自动化优化技术,该技术能够动态调整脑肿瘤MRI 图像分割网络结构以减少人工干预,在保证分割精度的同时显著提升计算效率。尽管如此,模型复杂度高、小样本泛化能力不足仍是当前亟待突破的关键瓶颈。
总体而言,上述脑肿瘤MRI 图像分割的研究逐步构建了从基础模块改进到复杂架构设计的连贯技术发展路径。展望未来,研究需进一步探索动态计算分配、边缘-语义联合优化等方向,以期有效应对脑肿瘤MRI 图像分割中面临的数据稀缺、类别不平衡与实时性需求等挑战,最终推动Transformer 模型在脑肿瘤MRI 图像分割临床实践中的深入应用与落地。
来源:陈雷,李光宇,杨锋,等.Transformer在脑肿瘤MRI图像分割中的研究进展[J].磁共振成像,2025,16(08):181-187+200.DOI:CNKI:SUN:CGZC.0.2025-08-027.